Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms