Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP34Q70CQ2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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USP34Q70CQ2 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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