Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms