Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPOCD1Q6ZMY3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms