Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms