Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms