Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD54Q6NXT1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms