Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPP4R4Q6NUP7 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 266.1 ms