Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC8EQ6NSJ5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms