Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms