Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms