Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC27A3Q5K4L6 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms