Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

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Length 1,059 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ZNF628Q5EBL2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ZNF628Q5EBL2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ZNF628Q5EBL2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ZNF628Q5EBL2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ZNF628Q5EBL2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ZNF628Q5EBL2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms