Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms