Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms