Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C4orf17Q53FE4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C4orf17Q53FE4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C4orf17Q53FE4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C4orf17Q53FE4 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C4orf17Q53FE4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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