Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms