Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GREB1Q4ZG55 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GREB1Q4ZG55 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GREB1Q4ZG55 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms