Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms