Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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HIF1AQ16665 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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