Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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