Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms