Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms