Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms