Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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