Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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SIX1Q15475 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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SIX1Q15475 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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SIX1Q15475 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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