Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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