Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
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