Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLCA4Q14CN2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLCA4Q14CN2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms