Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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