Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
EBI3Q14213 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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