Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CNGB1Q14028 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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CNGB1Q14028 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
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CNGB1Q14028 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
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CNGB1Q14028 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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CNGB1Q14028 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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CNGB1Q14028 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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CNGB1Q14028 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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CNGB1Q14028 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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CNGB1Q14028 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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