Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms