Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPSQ13938 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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