Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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