Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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