Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FHL3Q13643 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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