Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR4Q13639 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms