Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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