Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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PEX6Q13608 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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PEX6Q13608 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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