Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.1 ms