Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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