Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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