Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC090772.3-201ENST00000583267 735 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
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MKRN4PQ13434 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AL358176.4-201ENST00000428891 675 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
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MKRN4PQ13434 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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MKRN4PQ13434 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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MKRN4PQ13434 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
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