Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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