Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms