Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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