Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPAL4Q0D2K0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms