Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PSME1Q06323 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms