Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AL590240.2-201ENST00000413370 894 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC131934.1-201ENST00000527799 912 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC098617.1-207ENST00000594591 810 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 FAM228B-205ENST00000611127 975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 GCNT7-202ENST00000617620 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TNP2Q05952 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms